【摘 要】
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以金针菇(Flammulina velutipes)基因组序列为基础,对其SSR位点进行分析,设计16对引物对其中16个SSR位点进行标记设计,并对6个商业化的金针菇品种进行筛选。统计结果表明,金
【机 构】
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浙江省农业科学院园艺研究所,浙江师范大学化学与生命科学学院,
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以金针菇(Flammulina velutipes)基因组序列为基础,对其SSR位点进行分析,设计16对引物对其中16个SSR位点进行标记设计,并对6个商业化的金针菇品种进行筛选。统计结果表明,金针菇基因组有1279个位点,SSR位点密度为35.53/Mb,并以三核苷酸基序为主,重复数≥10的SSR(即高频)基序数目总计246个,占所有SSR位点的19.23%。设计的16对SSR标记均能扩增条带,多态率仅为18.75%。
Based on the genomic sequence of Flammulina velutipes, SSR loci were analyzed. Sixteen pairs of primers were designed to mark 16 SSR loci, and six commercial Flammulina velutipes varieties were screened. The statistical results showed that the Flammulina velutipes genome has 1279 genomes, the SSR locus density is 35.53 / Mb, and the trinucleotide motif is the major one. A total of 246 SSR (ie, high frequency) motifs with repetition≥10 were obtained. Accounting for 19.23% of all SSR loci. The designed 16 pairs of SSR markers could amplify the bands with a polymorphism of only 18.75%.
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