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利用基因编辑技术对大肠杆菌基因组进行改造可以研究基因功能,或改变其代谢途径大量生产原本成本较高的产物,从而获得可以生产特定产物的遗传稳定性工程菌株。目前可以对细菌基因组编辑的方法有Red同源重组、CRISPR/Cas9技术等。Red同源重组是比较传统的基因编辑技术,应用广泛,但编辑效率受整合片段大小的限制,基因编辑过程比较繁琐,且重组后基因组会有FRT位点残留。CRISPR/Cas9技术应用广泛,可靶向基因组特定位置进行编辑,但需要根据编辑位点设计特定的DNA打靶片段。随着人们对两种技术越来越深入的研究,衍生出了多种复合基因编辑技术。如Red同源重组和归巢核酸内切酶I-SceI的联合运用,Red同源重组和CRISPR/Cas9的联合运用等等。本综述总结了常用的几种基因编辑技术及复合基因编辑技术的基本原理及它们在大肠杆菌中的应用,可为原核生物基因编辑方法的选择提供依据。