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猪流行性腹泻的发病机理较复杂。有单一因素也有多因素联合作用发病。它涉及到疾病、饲养管理及营养、环境和遗传等方面。但总的来说，猪流行性腹泻可分成两大类：传染性因素和非传染性因素。传染性因素主要是指由病毒引起的传染性腹泻，而病毒引起的腹泻又可分成季节流行性腹泻与非季节性腹泻。季节性腹泻，主要由猪流行性腹泻病毒（PEDV）引起，以猪水样腹泻、呕吐、脱水和对哺乳仔猪高致死率为主要特征的一种高度接触性肠道传染病。