【摘 要】
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目的：利用生物信息学方法系统全面的探索食管癌中的差异表达基因以及免疫细胞特征。方法：获取GEO数据库中4个食管癌数据集并进行差异分析。进行Gene Ontology（GO）功能注释和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes（KEGG）通路注释；分别利用STRING数据库绘制蛋白质相互作用（PPI）网络图以及Cytoscape 软件的6种算法筛选核心基因。利用G
【基金项目】
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河南省医学科技攻关计划省部共建项目（编号：SBGJ202102070）；
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目的：利用生物信息学方法系统全面的探索食管癌中的差异表达基因以及免疫细胞特征。方法：获取GEO数据库中4个食管癌数据集并进行差异分析。进行Gene Ontology（GO）功能注释和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes（KEGG）通路注释；分别利用STRING数据库绘制蛋白质相互作用（PPI）网络图以及Cytoscape 软件的6种算法筛选核心基因。利用GEPIA2数据库对核心基因进行生存分析。采用TIMER2数据库和CIBERSORT反卷积算法进行免疫浸润分析。结果：共筛选出244个差异表达基因（DEGs），其中上调基因164个，下调基因80个。GO分析发现，DEGs主要富集在胞外区和细胞外间隙，与肿瘤侵袭转移相关。KEGG结果显示DEGs与PI3K-Akt信号通路和细胞外基质（ECM）受体相互作用信号通路相关。通过差异基因的蛋白相互作用分析，我们发现3个核心基因CXCL8、MMP9和MMP13在ESCC中高表达。免疫浸润结果显示，巨噬细胞和静息树突状细胞显著增加，而肥大细胞和单核细胞显著减少。结论：筛选出的ESCC核心基因和免疫浸润细胞可能在肿瘤中起着重要作用，有望成为ESCC潜在的肿瘤标志物且用于ESCC的诊断和治疗。
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