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基于活菌亲和吸附法筛选的乳源蛋白抗菌肽BCp12具有广谱的抗菌效果，但其抑菌机制的研究尚不清楚。本研究利用紫外吸收法、流式细胞仪、傅立叶变换红外光谱、扫描电镜及透射电镜等技术探究抗菌肽BCp12对大肠杆菌壁膜的损伤并通过凝胶阻滞和荧光光谱实验研究BCp12对菌体DNA的结合作用及方式。结果表明：BCp12引起大肠杆菌壁膜亲水性增加，菌体细胞吸附率从79.95%下降至64.73%，对菌体壁膜脂肪酸、蛋白、多肽酰胺、多糖及指纹信息区都有明显影响，菌体细胞膜损伤显著（损伤率为25.1%，P<0.05），且胞内紫外吸收物质泄漏，菌体形态变得粗糙皱缩，细胞质内部结构遭到严重破坏并出现空化现象；BCp12能够与溴化乙锭( Ethidium Bromide， EB)相互竞争结合位点，并以嵌入方式结合DNA，产生凝胶阻滞现象，影响DNA的正常复制，进而抑制菌体的生长繁殖。本研究部分解明了BCp12的抗菌机理。