【摘 要】
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基于网络药理学与分子对接方法,探讨中药人参-五味子配伍治疗特发性肺间质纤维化(idiopathic pulmonary fibrosis,IPF)的潜在分子机制.通过GeneCards、CTD、GEO等数据库预测IPF疾病靶标基因,从TCMSP平台筛选人参-五味子有效活性成分及其治疗靶标,构建中药-活性成分-靶标基因调控网络.通过STRING网站分析靶标基因蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)关系并筛选出其中的关键基因;通过SwissDock在线平台进行
【机 构】
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无锡市第二中医医院呼吸科,江苏无锡214121
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基于网络药理学与分子对接方法,探讨中药人参-五味子配伍治疗特发性肺间质纤维化(idiopathic pulmonary fibrosis,IPF)的潜在分子机制.通过GeneCards、CTD、GEO等数据库预测IPF疾病靶标基因,从TCMSP平台筛选人参-五味子有效活性成分及其治疗靶标,构建中药-活性成分-靶标基因调控网络.通过STRING网站分析靶标基因蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)关系并筛选出其中的关键基因;通过SwissDock在线平台进行关键靶标与有效活性成分的分子对接,验证评估其结合潜力;利用R语言进行关键基因的基因本体(gene ontology,GO)功能注释与基于京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析.结果 表明:共筛选获得人参-五味子含山奈酚、豆甾醇等23个有效活性成分,作用于48个IPF靶标基因,并从靶标基因PPI网络中筛选获得AKT1、PTGS2、IL1B等20个关键基因,关键基因与药对活性成分分子对接能量稳定,结合牢固;关键基因主要富集于核受体活性、类固醇受体活性等67个GO生物学过程,以及白介素17信号通路、肿瘤坏死因子TNF信号通路等90个KEGG信号通路.人参-五味子配伍益气养阴,其可能通过调节机体免疫、抗纤维化、抗氧化应激、抑制炎症等多通路机制发挥治疗IPF的作用.
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