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通过对傅立叶级数(FS)和离散傅立叶变换(DFT)的研究,比较了它们在电力系统故障检测及微机保护中的应用.对含有分次谐波的EMTDC仿真数据进行计算分析,表明分次谐波、衰减直流分量的存在使得基于FS的保护算法存在误差.而增加数据窗长度,可以使基于DFT的保护算法克服分次谐波和衰减直流的影响,对工频量进行较为精确的提取.