【摘 要】
：
杏(Prunus armeniaca)是一种风味独特、具有重要经济和营养价值的果树.选择以杏品种'美华'为试材,利用先进的Illumina、PacBio和Hi-C组合技术,分别获得Illumina数据40.92 Gb
【机 构】
：
山东省果树研究所,山东泰安271000
论文部分内容阅读
杏(Prunus armeniaca)是一种风味独特、具有重要经济和营养价值的果树.选择以杏品种'美华'为试材,利用先进的Illumina、PacBio和Hi-C组合技术,分别获得Illumina数据40.92 Gb、PacBio数据32.56 Gb和Hi-C辅助组装数据36.9 Gb,组装出全新的杏基因组HiC Ver 1.0,其序列叠连群(contig)总长和半总长位置叠连群(N50)大小分别是243.35和1.81 Mb,包含未知碱基的序列叠连群(scaffold)总长和N50大小分别是243.37和30.07 Mb.组装基因组的98.0％挂载到8个假分子形式的染色体.基因组杂合率0.425％,重复序列占47.1％,GC含量37.4％,预测出23 445个蛋白质编码基因.利用12种植物共有的664个单拷贝基因家族构建系统发育树,结果表明杏和梅(P mume)约在10.7百万年(Ma)前分歧,5种核果类果树与2种仁果类果树的祖先约在57.2 Ma前分歧.与杏和梅的共同祖先相比,杏有198个基因家族扩张、729个基因家族收缩.与其他4种核果类果树比较,杏有327个特有基因家族(437个特有基因);与其他11种植物比较,杏有90个特有基因家族(187个特有基因).
其他文献
本文在大量实验室研究和室外模拟试验基础上,采用现场的原材料,通过优化配合比设计,配制高效水下不分散混凝土和水下灌注桩混凝土(自密实混凝土),抽样检测及超声回弹结果表明
Geoclimatic factors related to the uplift of the Himalaya and the Quaternary climatic oscillations influence the population genetic connectivity in the Himalaya
以越橘品种'双丰'为试材,通过对植株覆盖白、紫、蓝、黄和红色塑料薄膜,研究了全光照下覆盖不同颜色薄膜对越橘光合能力及果实品质的影响.结果 表明:与对照相比,全光照下覆盖
In EUROCRYPT 2009 Galbraith, Lin and Scott constructed an efficiently computable endomorphism for faster elliptic curve cryptosystem for a large family of e
对于有限域GF(q)上一个周期为N的序列{s(t)}，它的自相关值进行了定义，经过严密的推理，得出了对于GF(3)上三条的非平衡的三阶分圆序列s，当p=a2+3时，其中a∈Z，则上三条序列的自相关值
基于Hohenberger和Waters的签名提出了一个新型聚合在线离线签名方案,并给出了一个标准模型下的证明.该方案的安全性可规约到计算性的DiffieHellman问题.方案适用于无线传感
为研究不同海拔对钩藤生长及药用成分含量的影响,选取二年生钩藤幼苗为研究对象,将同一批钩藤幼苗分别种植于不同海拔高度(780、1 080、1 380 m),测定钩藤的形态指标、生物量
相比现有最有效PRESENT的DFA分析中，本文利用两种不同长度随机错误，对PRESENT密码算法进行四种错误模型的DFA分析，最少仅需17对错误样本就可以分析得到最后一轮白化密钥的64bit，
Poa sect.Poa subsect.Nivicolae(Prob.)Tzvelev was circumscribed to include four species of the Soviet Union:Poa shumushuensis,Poa caucasica,Poa irkutica,and Poa
本研究采用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术对马尾松大径材和小径材进行小RNA分子测序,构建了6个小RNA文库,共检测到1.42×l07～1.59xl07条序列.鉴定得到1 567个miRNA,其中