【摘 要】
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目的 通过生物信息学方法筛选和分析肿瘤数据库中胃癌突变基因,并分析其与患者预后及免疫功能的相关性,为胃癌患者的免疫治疗提供理论和数据参考。方法 从TCGA及ICGC数据库中下载胃癌患者的基因突变及临床数据,通过R软件筛选出与胃癌患者生存率和预后密切相关的共同高频突变基因。并对高频突变基因进行GSEA富集分析,运用CIBERSORT算法计算肿瘤浸润免疫细胞的相对丰度,探究共同高频突变基因对肿瘤浸润免
【基金项目】
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山东省重点研发计划项目(2019JZZY011009);
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目的 通过生物信息学方法筛选和分析肿瘤数据库中胃癌突变基因,并分析其与患者预后及免疫功能的相关性,为胃癌患者的免疫治疗提供理论和数据参考。方法 从TCGA及ICGC数据库中下载胃癌患者的基因突变及临床数据,通过R软件筛选出与胃癌患者生存率和预后密切相关的共同高频突变基因。并对高频突变基因进行GSEA富集分析,运用CIBERSORT算法计算肿瘤浸润免疫细胞的相对丰度,探究共同高频突变基因对肿瘤浸润免疫细胞的影响。结果 在TCGA和ICGC数据库中发现21个共同的高频突变基因,其中FAT4与患者临床预后及肿瘤突变负荷相关。通过GSEA富集分析和CIBERSORT算法,发现FAT4突变与免疫系统相关信号通路的激活及免疫应答的增强相关。结论 胃癌中FAT4突变频率较高,且其突变与患者较好的预后及抗肿瘤免疫功能的增强相关。因此,FAT4具有作为预测胃癌患者免疫应答的生物标记物的潜力。
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