【摘 要】
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目的 本课题组前期发现散发性结直肠癌2号染色体存在高频杂合缺失现象,提示可能有抑癌基因的存在,本研究拟在该区域筛选与结直肠癌发生相关的抑癌基因.方法 构建包含2号染色体高频杂合缺失区域的基因芯片,对19例结直肠癌标本进行表达谱分析,并与临床病理特征加以统计学分析,筛选该区域与结直肠癌相关的未知抑癌基因,然后对筛选出的候选基因采用实时定量聚合酶链反应(Real-time PCR)进行初步验证.结果
【机 构】
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200080,上海交通大学附属第一人民医院普通外科;
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目的 本课题组前期发现散发性结直肠癌2号染色体存在高频杂合缺失现象,提示可能有抑癌基因的存在,本研究拟在该区域筛选与结直肠癌发生相关的抑癌基因.方法 构建包含2号染色体高频杂合缺失区域的基因芯片,对19例结直肠癌标本进行表达谱分析,并与临床病理特征加以统计学分析,筛选该区域与结直肠癌相关的未知抑癌基因,然后对筛选出的候选基因采用实时定量聚合酶链反应(Real-time PCR)进行初步验证.结果 在前期研究基础上,通过数据库检索,挑选了17个基因进行相关基因筛选.发现ACVR1C在89.47％ (17/19)的肿瘤组织中表达下调,其中10例肿瘤组织中下调比例超过2倍.通过Fishers精确法分析,ACVR1C的表达与临床病理特征之间无明显相关.在此基础上,通过Real-time PCR验证结果也发现ACVR1C基因的表达与芯片结果相符,在结直肠癌组织中表达显著下调.结论 通过表达谱芯片和生物信息学分析,并通过Real-time PCR初步验证,推测ACVR1C基因可能是与结直肠癌发生相关的抑癌基因.
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