基于MHC遗传标记的改则县本地牦牛与半野血牦牛群体遗传多样性评估

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本研究利用MHC基因区域2个遗传标记(BF1和BM1258)对改则县的本地牦牛(GZD,16头)和半野血牦牛(GZY,18头)进行遗传多样性评估.结果 表明,BF1位点的期望杂合度(HE=0.719 96)和多态信息含量(PIC=0.660 63)以及等位基因数(NA=11)都要高于BM1258位点(HE=0.567 73、PIC=0.455 53、NA=6),但BF1位点的观测杂合度(HO=0.303 31)小于BM1258位点(HO=0.664 71).就群体而言,GZD的期望杂合度为0.672 7±0.093 4(HE±SD)、观测杂合度为0.556 3±0.089 2(H0±SD)以及PIC为0.585 34,均高于GZY.GZD的近交系数(FIS=0.178)小于GZY (FIS=0.337).通过2个微卫星位点基因型共构建了17种单倍型,GZD中合有12种单倍型,GZY中存在11种单倍型.在单倍型水平上,GZD的期望杂合度(HE)为0.875 9,观测杂合度为0.800 0±0.103 3,多态信息含量为0.832 3,也略高于GZY相关参数.2个群体之间的遗传分化指数在2个水平差异不显著,FsT=-0.013 70(位点水平),FsT=-0.003 00(单倍型水平).总体而言,2个牦牛群体的MHC免疫区域遗传多样性丰富,暗示其抗病性和适应性遗传基础优秀,2个群体遗传差异不明显,加之半野血牦牛种群近交系数偏高,故建议对2个群体采取混群合并保种,提高种畜利用率,防止近交系数持续增高.
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