新型戊肝病毒ORF3和部分ORF1基因的序列分析

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用RT-PCR方法对2例感染新型HEV的样品进行了检测,并对PCR 产物进行了克隆及 测序。检测结果显示用常规PCR检测易造成ORF3中GC丰富区的缺失,但在常规PCR反应液中加 入GC melt溶液可成功地扩增GC丰富区。序列分析显示T1和T11属于同一基因型,但不同于已 报道的HEV I型、II型和III型,为一新的基因型。T1和T11与I型在该区的核苷酸同源性为79 %~82%; 与II型的同源性为80%~81%; 和III型的同源性为83%~85%。
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