糖尿病前期患者长链非编码RNA的筛选和功能研究

来源 :中国病原生物学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiongying1207
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目的通过初步生物信息学分析,筛选2型糖尿病前期相关的长链非编码RNA。方法选取4例糖尿病前期患者与健康者,采集血样,提取总RNA并进行质量检测,合格后合成cDNA纯化标记,运用芯片杂交、扫描,数值标准化等处理后,以差异倍数≥2且P≤0.05为纳入标准,检测配对糖尿病前期患者中的lncRNAs差异表达谱,并对差异lncRNAs进行基因本体论(GO)分析和通路分析,从而了解LncRNAs参与的生物学功能。结果与糖尿病相关的差异表达的lncRNAs共55个,其中上调lncRNAs 17个,下调37个。mRNAs共筛选出36个,其中上调16个,下调20个。通过GO分析,LncRNAs共表达的mRNAs主要参与炎症细胞反应、细胞代谢凋亡、γ干扰素正调控、离子运输、多糖降解等生物过程,参与的细胞组件包括电压门钾离子通道、炎症小体、细胞膜成分、内质网和高尔基体等成分,体现了基质金属蛋白酶活性、电压门钾通道活性参与心肌细胞动作电位复极、芳基磺基转移酶活性、半胱氨酸内肽酶活性细胞凋亡执行、白介素受体1结合等分子功能。细胞通路分析显示LncRNAs共表达的mRNAs所参与的信号通路主要涉及到糖原的分解代谢、嘌呤代谢和昼夜节律通路等。结论糖尿病前期患者血液中存在差异表达的LncRNAs,生物学功能和通路分析提示这些差异表达的LncRNAs可能参与糖尿病前期的发生。
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