基于生物信息学方法构建类风湿性关节炎miRNA-mRNA调控网络

来源 :国际检验医学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：kalok

【摘要】

：

目的基于生物信息学方法构建类风湿性关节炎核心微小RNA(miRNA)-mRNA调控网络并筛选相关核心基因,探索其在类风湿性关节炎疾病中的分子调控机制。方法从基因表达综合(GEO)数

【作者】

：

曹维维袁成良

【机构】

：

德阳市人民医院检验科

【出处】

：

国际检验医学杂志

【发表日期】

：

2021年5期

【关键词】

：

类风湿性关节炎基因芯片调控网络 rheumatoid arthritis gene chip regulatory network

【基金项目】

：

德阳市科技局项目(2017SZ019)

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目的基于生物信息学方法构建类风湿性关节炎核心微小RNA(miRNA)-mRNA调控网络并筛选相关核心基因,探索其在类风湿性关节炎疾病中的分子调控机制。方法从基因表达综合(GEO)数据库下载miRNA和mRNA基因表达谱芯片GSE72564和GSE55235。采用GEO2R分析工具筛选差异表达的miRNA和mRNA,应用miRNet在线数据库分析预测miRNA差异表达的靶基因并与mRNA数据集筛选出的差异基因进行交叉匹配,获得miRNA-mRNA相互作用关系对。使用ClusterProfiler包对miRN

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