6种血清型鸭疫里默氏菌SSPA基因的克隆及序列分析

来源 :福建农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：yusijin11

【摘要】

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为了解鸭疫里默氏菌SSPA基因的生物学信息,参照GenBank登录的鸭疫里默氏菌SSPA基因序列设计了1对特异性引物,成功克隆6种血清型鸭疫里默氏菌SSPA基因,并利用生物信息学软件DN

【作者】

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陈红梅程龙飞傅光华施少华万春和傅秋玲张丹青黄瑜

【机构】

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福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心

【出处】

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福建农业学报

【发表日期】

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2015年9期

【关键词】

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鸭疫里默氏菌 SSPA基因克隆序列分析 duck Riemerella anatipestifer SSPA gene Cloning Seque

【基金项目】

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现代农业产业技术体系建设专项（CARS-43）, 福建省自然科学基金项目（2013J0101？）, 福建省科技计划项目——省属公益类科研院所基本科研专项（2013R1025-7）, 福建省种业与产业化工程项目（2011FJZY-9）, 福建省农业科学院青年创新基金项目（2012DVB-16）

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为了解鸭疫里默氏菌SSPA基因的生物学信息,参照GenBank登录的鸭疫里默氏菌SSPA基因序列设计了1对特异性引物,成功克隆6种血清型鸭疫里默氏菌SSPA基因,并利用生物信息学软件DNAstar及在线分析工具SignalP V4.0、TM-HMM Server V.2.0、NetNGly c1.0、YinOYang 1.0和NetPhos 2.0对推导的氨基酸序列进行分析。结果显示：该基因的ORF全长1 692bp,可编码563个氨基酸;氨基酸序列含有1个潜在的N-糖基化位点,1个潜在的O-糖基化位点,

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