论文部分内容阅读
目的
由于宫颈癌的临床确诊与预后不佳,急需寻找到用于筛查宫颈癌发病过程的生物标志物。
方法本文通过对TCGA数据库中来源于宫颈癌样本的高通量转录组测序(含mRNA及miRNA)进行生物信息学数据挖掘,筛选在癌症和癌旁组织中差异表达的miRNA及mRNA,并与宫颈癌患者的临床数据做关联分析。
结果从18个差异表达的miRNA中筛选出4个miRNA(hsa-mir-101-2、hsa-mir-128-1、hsa-mir-145和hsa-mir-642a)与宫颈癌的生存显著相关,可作为宫颈癌的生物标志物;同时系统分析了这4个miRNA的下游1037个靶基因及其所参与的信号通路(如MAPK信号通路、FOXO信号通路和miRNA in Cancer信号通路)。
结论宫颈癌患者中这四个差异表达的miRNA(mir-hsa-mir-101-2、hsa-mir-128-1、hsa-mir-145和hsa-mir-642a)可作为宫颈癌的生物标志物,对转录组数据的深入挖掘为宫颈癌的深入研究提供新的思路。