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针对低信噪比下多相码信号参数估计方法性能不佳的问题,提出了一种低信噪比下基于积分二次相位函数(IQPF)和分数阶傅里叶变换(Fr FT)的联合参数估计方法。首先在理论上推导出IQPF将多相码信号的所有脊线累积为一个峰值,并利用IQPF估计出的调频率将Fr FT的二维搜索变为一维搜索,从而估计出其他参数。仿真实验表明,所提方法在计算量以及估计精度上优于传统方法。