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苜蓿黄萎病危害苜蓿、马铃薯、啤酒花、草莓、烟草、茄子、大豆、花生、红豆等经济作物和牧草。1996年，在新疆阿克苏地区温宿县托乎拉乡首次发现疫情。2000年～2001年，实施大规模农业植物有害生物疫情普查，在阿克苏、巴音郭楞、伊犁、阿勒泰4地（州）新发现39个疫情发生点。目前，该病发生范围仅限于南北疆的4地（州）9个县（市）、35个乡镇的37个村的苜蓿作物上，共有疫情发生点39个。