碱基与氨基酸二肽间的氢键相互作用

来源 :辽宁师范大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户：esinstra

【摘要】

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对于碱基一蛋白质之间的相互作用，氢键的形成及断裂起着重要的作用．选取7种氨基酸二肽和3种碱基，以它们之间形成单根氢键的体系为研究对象，在abinitioBaLYP／6-311＋＋G（d，p）水平下进行结

【作者】

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杨忠志王越

【机构】

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辽宁师范大学化学化工学院,辽宁师范大学物理与电子技术学院

【出处】

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辽宁师范大学学报(自然科学版)

【发表日期】

：

2013年2期

【关键词】

：

氢键碱基氨基酸二肽氢键拟合函数 ab INITIO ABEEMΣΠ/MM hydrogen bond base amino acid dipeptide

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对于碱基一蛋白质之间的相互作用，氢键的形成及断裂起着重要的作用．选取7种氨基酸二肽和3种碱基，以它们之间形成单根氢键的体系为研究对象，在abinitioBaLYP／6-311＋＋G（d，p）水平下进行结构优化，MP2／6-311＋＋G（d，p）水平下进行能量的计算．同时应用ABEEMδπ／MM方法优化结构和计算能量．通过改变氢键相互作用区域的静电相互作用参数κH-bond和形成氢键的氢原子与其受体原子的孤对电子之间距离Rlp,H来拟合函数κH-bond（Rlp,H）．用所得函数对选取的复合物进行结合能计算

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