【摘 要】
:
[目的] 为了后续深入研究克氏原螯虾甲壳肽基因的功能.[方法] 以Pc-crustin 6甲壳肽基因作为研究对象,通过设计特异性引物进行PCR扩增,利用生物信息学软件进行氨基酸序列比对与系统进化树分析,探讨Pc-Crustin 6的分子特性;并利用qRT-PCR技术分析目的基因在不同组织中的表达水平,检测鲶爱德华氏菌刺激后基因的表达模式.[结果] Pc-crustin 6的cDNA序列全长为465 bp,开放阅读框包括384 bp,编码127个氨基酸残基;在分子的N端包含一个由25个氨基酸残基组成的信号肽
【机 构】
:
内蒙古科技大学生命科学与技术学院,内蒙古自治区 包头 014010;内蒙古科技大学图书馆,内蒙古自治区 包头 014010
论文部分内容阅读
[目的] 为了后续深入研究克氏原螯虾甲壳肽基因的功能.[方法] 以Pc-crustin 6甲壳肽基因作为研究对象,通过设计特异性引物进行PCR扩增,利用生物信息学软件进行氨基酸序列比对与系统进化树分析,探讨Pc-Crustin 6的分子特性;并利用qRT-PCR技术分析目的基因在不同组织中的表达水平,检测鲶爱德华氏菌刺激后基因的表达模式.[结果] Pc-crustin 6的cDNA序列全长为465 bp,开放阅读框包括384 bp,编码127个氨基酸残基;在分子的N端包含一个由25个氨基酸残基组成的信号肽序列,C端包含一个由8个保守的半胱氨酸残基构成的WAP结构域.Pc-crustin 6在被检测的5个组织中均存在一定的表达,其中,鳃组织的相对表达量最高.鲶爱德华氏菌刺激后,Pc-crustin 6在血细胞、肝胰腺、鳃、肠组织中均表现出了明显的上调趋势.[结论] 机体在受到鲶爱德华氏菌刺激后,Pc-crustin 6相对表达量发生改变,推测其在小龙虾抗鲶爱德华氏菌过程中发挥了作用.
其他文献
[目的] 髓细胞组织增生蛋白(Myelocytomatosis proteins,MYC)是植物茉莉酸信号转导途径中的重要转录因子.鉴定并分析茶树MYC转录因子有助于了解其潜在的分子机制.[方法] 采用生物信息学方法,对茶树CsMYC转录因子进行全基因组范围内的鉴定与分析.[结果] 从茶树基因组中总共鉴定出9个CsMYC成员,分布在茶树的5条染色体上.系统进化分析表明植物MYC家族可能起源于陆生植物并发生了谱系特异性分化事件.结构分析表明该家族内含子数目为0~3个,说明该家族在进化过程中发生内含子丢失事件
[目的] 从甘蔗基因组中分离Ty3-gypsy类逆转座子的RT基因序列,分析序列的特点、差异及系统进化关系,为研究其转录活性和调控功能奠定基础.[方法] 根据Ty3-gypsy类逆转座子RT基因序列的保守区设计简并引物,对甘蔗品种新台糖22的基因组DNA进行PCR扩增,目的条带经回收、克隆和测序后,对所获得序列进行生物信息学分析.[结果] 目的条带大小约430 bp,成功分离到36条RT基因序列,只有1条序列的长度为430 bp,其余序列的长度均为432 bp,AT所占比为56.71%~64.81%,AT
[目的] 分析ZmCOL3基因编码蛋白的结构及功能,预测ZmCOL3基因可能具备的功能,为该基因在玉米开花调控及其他功能的研究提供思路.[方法] 通过生物信息学的方法对ZmCOL3基因编码蛋白质的理化性质、保守结构域、二级结构、三级结构、信号肽、跨膜结构域、亚细胞定位及启动子顺式作用元件进行了预测,并对该基因在玉米不同组织的表达量进行了分析.[结果] ZmCOL3基因所编码的蛋白包含335个氨基酸,相对分子质量为35.39 kD,理论等电点为5.04,属于酸性蛋白,具有亲水性和不稳定性,含有1个CCT结构
[目的] 为在辣椒生产中合理利用枯草芽孢杆菌悬浮种衣剂提供理论依据.[方法] 以扬椒2号为材料,研究了枯草芽孢杆菌悬浮种衣剂母液与种子不同药种比[1:2、1:4、1:6、1:8、1:10和1:12 (mL:g)]对辣椒幼苗生长和生理特性的影响.[结果] 与对照(不包衣)相比,种衣剂处理提高了辣椒幼苗出苗率、株高、茎粗、叶面积、植株干重和壮苗指数,且提高幅度随药种比的降低呈先上升后下降的趋势,以药种比1:8的提高幅度最大.种衣剂处理提高了叶片净光合速率(Pn)、蒸腾速率(Tr)和气孔导度(Gs),降低了胞间
[目的]确定福建某鸭场雏鸭以出现角弓反张和肝脏出现肿大并伴有密集出血点为主要病征的高死亡率病害的病原,并制备可特异性检测的多克隆抗体,以期为福建省鸭流行病学研究提供素材.[方法]取该鸭场病死鸭肝脏组织进行病毒的分离鉴定,并对病毒进行全基因测序.利用pGEX-4T-1载体构建该病毒优势抗原表位基因的高效表达系统,制备VP1多克隆抗体,并用Western-blotting检测其特异性.[结果]应用非免疫的鸭胚从疑似鸭病毒性肝炎的鸭肝脏中分离到1株病毒.该分离毒在鸭胚连续传6代后死亡率约为70%,且死胚尿囊液分
[目的]探究DlAGOMEL1基因在龙眼体胚发生过程中的调控作用,并明确该基因在亚细胞中的定位,为深入研究DlAGOMEL1基因的功能提供理论依据.[方法]采用RT-PCR技术,基于龙眼基因组数据库,克隆DlAGOMEL1基因的CDS及该基因的5\'端上游启动子序列,采用生物信息学方法分析该基因,通过实时荧光定量PCR技术检测其在龙眼体胚不同发育阶段的相对表达量,同时,构建该基因的瞬时融合表达载体,得到重组质粒,并将其瞬时转入洋葱内表皮细胞中,用荧光共聚焦显微镜观察细胞绿色荧光信号.[结果]获得DlA
[目的]研究茶树的全长转录组测序,以期为解析控制茶叶质量形成的分子机制提供理论依据.[方法]以贵州都匀地区福鼎大白茶叶、根和茎为材料,采用牛津大学的纳米孔技术(Oxford Nanopore Technology,ONT)进行全长转录组测序;将茶树叶、根和茎进行基因表达量分析;为了验证转录组测序结果的可靠性,随机抽取4个基因进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR).[结果](1)获得69379条全长转录本、93102个SSR、45852个ORF、6335个转录因子和2229个lncRNA;(2)获得叶与根
[目的] 对福建省南平市某肉鸡场不明病因造成肉鸡死亡的病原进行确诊.[方法] 通过对鸡传染性支气管炎病毒(Infectious bronchitis virus,IBV)、腺病毒(Fowl adenovirus,FadV)、鸡细小病毒(Chicken parvovirus,ChPV)、新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)、鸡传染性贫血病毒(Chicken infectious anemia virus,CIAV)、传染性法氏囊病毒(Infectious bursal Dis
[目的] 以14个观赏海棠品种为研究对象,初步探讨观赏海棠花色与花瓣pH、表皮细胞形态特征之间的关系.[方法] 分别采用比色卡及色差计对不同色系(白色、粉红色、紫红色、暗红色等)观赏海棠品种盛花期及不同开花进程(大蕾期、盛花期、末花期)的海棠花瓣,进行色彩评价,同时测定其细胞pH值,通过电镜扫描观察花瓣表皮细胞形态特征, 探讨海棠花色与花瓣pH值、表皮细胞形态特征的关系.[结果] 白色系、粉色系品种pH值5.24~6.37,而暗紫红、紫红色系pH值4.98~5.53;从白色系到紫红色系,花瓣pH值整体呈现
[目的]鉴定并分析CsETR基因,预测其潜在分子功能,以期从分子水平了解乙烯受体在茶树生长过程中应对胁迫的作用机制.[方法]采用生物信息学分析方法鉴定ETR基因家族成员并预测其潜在分子功能,采用实时荧光定量分析法分析其在不同胁迫处理下的表达水平.[结果]从茶树基因组中确定了6个茶树ETR基因家族成员,均包含N端跨膜区、GAF区和组氨酸(His)激酶结构域;系统发育树分析显示其为两组,与乙烯受体的两个亚家族分别对应;茶树ETR基因家族中每个成员含有1~12个外显子.ETR家族基因在茶树果实和茎中表达量较高,