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建立基于相对业绩的高校院（系）激励机制需要从简政放权、财务核算、管理模式等方面构建以院（系）为重心的高校内部管理体制；需要从院（系）经济指标会计核算、社会贡献率指标核算两大方面科学设置院（系）业绩考评指标体系；需要构建各院（系）的相对业绩计算模型，基于相对业绩对院（系）进行物质奖励（确定绩效工资总额）和精神激励。