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为了研究薏苡属不同种质之间的关系，采用基因组原位杂交（GISH）技术，以四倍体栽培薏苡（2n=20，AABB）基因组总DNA作为探针，分别对广西的栽培薏苡、野生薏苡和水生薏苡体细胞中期染色体进行基因组原位杂交。杂交结果显示，栽培薏苡和野生薏苡染色体都被强烈而密集的杂交信号所标记，说明野生薏苡与栽培薏苡在基因组染色体水平上的同源程度很高，保守重复序列占很大比重；水生薏苡的基因组中有20条染色体的DNA成分与栽培薏苡的基因组DNA高度同源，推断供试的水生薏苡种属于广西六倍体水生薏苡居群。