【摘 要】
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蛋白质交互信息是解决大量医学难题的关键信息,这些信息都记录在医学文献中,随着生物医学文献的大量增加,以手工收集信息的方式已经难以满足实际需求.对此,提出一种基于弱监
【机 构】
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南京航空航天大学计算机科学与技术学院
【基金项目】
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国家自然科学基金（61202132）
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蛋白质交互信息是解决大量医学难题的关键信息,这些信息都记录在医学文献中,随着生物医学文献的大量增加,以手工收集信息的方式已经难以满足实际需求.对此,提出一种基于弱监督的方法识别文本中的蛋白质交互关系.该方法首先根据文本库产生蛋白质交互的向量表示;接着根据蛋白质对实例的相似性对实例聚类,产生提取模式;然后根据提取模式从文本库中找到新的满足条件的蛋白质对实例,作为候选实例;最后对候选实例对应的蛋白质对进行评估,并将满足条件的蛋白质对添加到种子集合中.该方法仅需少量的蛋白质对作为种子,通过迭代算法不断扩充种子集
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