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利用RAPD标记分析了珠母贝属常见的马氏珠母贝、大珠母贝、珠母贝、解氏珠母贝以及珍珠贝属常见企鹅珍珠贝的系统发育，同时分析了马氏珠母贝和大珠母贝不同地理种群的遗传多样性，并以邻接法（neighbor-joining，NJ）构建了种间及种群间的系统分支图。结果表明：（1）在珍珠贝5种9个种群中，大珠母贝的4个种群最早聚在一起分别成为2个姊妹群，这2个姊妹群聚合为1个单元群后，又与珠母贝聚在一起，然后才与马氏珠母贝姊妹群聚合成的单元群聚合，再与解氏珠母贝聚合，最后才与企鹅珍珠贝聚合；（2）珠母贝属4种珍珠贝进