【摘 要】
:
通过生物信息学方法预测hsa-miR-192-3p的靶基因及其靶基因的可能功能。首先通过miRbase在线数据库对hsa-miR-192-3p的碱基序列及序列在各物种间的保守性进行分析,再通过miRG
【机 构】
:
沈阳医学院公共卫生学院职业卫生教研室
【基金项目】
:
国家自然科学基金面上项目(81070128);沈阳市“高层次创新人才计划”项目(No.RC170408);辽宁省重点研发计划(No.2018225013);沈阳医学院硕士研究生科研创新基金项目(No.Y20170609);沈阳中青年创新支持计划(No.RC180379);教育部留学启动基金(No.20121707);人力资源与社会保障部科技项目择优资助(No.2015)
论文部分内容阅读
通过生物信息学方法预测hsa-miR-192-3p的靶基因及其靶基因的可能功能。首先通过miRbase在线数据库对hsa-miR-192-3p的碱基序列及序列在各物种间的保守性进行分析,再通过miRGator v3.0在线数据库查看hsa-miR-192-3p在各个组织器官中的表达丰富度情况;其次,应用TargetScan和miRanda在线数据库预测hsa-miR-192-3p的靶基因;最后,将预测得到的两个数据库的靶基因交集用DAVID在线数据库进行功能富集分析和信号转导通路富集分析。结果表明:hsa-miR-192-3p在人、家鼠、猕猴等生物中存在高度保守性;hsa-miR-192-3p在胃肠道、肾脏、肝胆系统、干细胞、鼻、脾、胸腺中表达丰富度较高;通过两个靶基因预测软件预测的靶基因取交集后共有190个;功能富集分析发现hsa-miR-192-3p靶基因富集在细胞质、细胞核、质膜、高尔基体等15个细胞组件(p<0.05),参与蛋白结合、GTP酶活性、锌离子跨膜转运蛋白活性等7个分子功能(p<0.05),涉及金属离子运输、RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录阳性调控、基因表达调节、钙离子跨膜运输、胚胎发育等18个生物过程(p<0.05);预测靶基因集合显著富集于癌症通路与催乳素信号通路中(p<0.05)。得出结论:hsa-miR-192-3p预测的靶基因集合富集于多个生物过程,与肿瘤密切相关,生物信息预测为今后的研究奠定了一定的理论基础,为后续实验验证提供了研究方向。
其他文献
教育的终身目标很多,其中之一是要帮助人们树立终身学习的观念,并且学会掌握自主学习的技能。目前,我国正在逐步深化着以人为本的教育理念,但是因为教育受到建国以来固有的教育模
面对"一带一路"战略机遇,厦门港应迎接挑战,做好转型升级的准备工作。本文介绍了"一带一路"战略的背景及定义,通过SWOT模型,分析厦门港的现状,并有针对性提出厦门港转型升级
文章在研究了国外经验后,提出明确政府在信用担保体系中的作用、促进中小企业互助担保组织的发展、完善信用体系建设、协调银行和信用担保机构的关系和设立行业自律组织等对
<正> QJ15型桥梁轻型拼装式悬吊检查架(简称QJ15型桥梁检查架),是为桥梁检查、试验、维修及加固等作业而提供的空中作业平台。在国内外,目前由于桥梁型式多种多样,难以找到能
<正>2000年以前我国资源获取型海外并购的交易量和交易次数都较少,而且都是由国有大中型企业主导的。如1986年中信加拿大公司取得加拿大赛尔加纸浆厂50%的股权,稳定了造纸原
<正>标准编号:GB/T 18884.1-2015范围:本部分规定了家用厨房设备的术语、定义。本部分适用于家用厨房设备领域。发布/实施日期:2015-09-18/2016-04-01发布单位:中华人民共和
中小企业在我国经济社会发展中具有重要的战略地位。目前我国的中小企业已经超过1000万家,占企业总数的99%,提供了近80%的城镇就业岗位,完成了75%以上的企业技术创新,创造的
中国园艺产品向来是具有国际竞争优势的传统产品,而随着国外环境规制水平的普遍提高,本国的出口量出现了连年下滑,过去一味强调成本竞争力的做法已不再适用。本文以行业污染
介绍了大空间公共建筑防火分区设计的基本要求,分析了防火墙、防火卷帘、防火水幕和防火隔离带4种分隔措施在大空间公共建筑防火分区设计中的应用特点及要求,重点研究了防火
抗菌肽(antimicrobial peptides)是一类能够抑制细菌、真菌的小分子多肽。到目前为止,2600多种抗菌肽被分离并鉴定。抗菌肽不但具有良好的抑菌效果,而且不易产生耐药性,是传