【摘 要】
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为快速、准确地对番茄枯萎病菌Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici（FOL）和番茄颈腐根腐病菌F. oxysporum f. sp. radicis-lycopersici（FORL）进行检测，基于尖孢镰刀菌F. oxysporum多聚半乳糖醛酸外切酶基因pgx4的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）位点，设计F
【基金项目】
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浙江省自然科学基金（LY19C150010）； 财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系（CARS-23-G44）； 国家重点研发计划（2017YFE0114500）；
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为快速、准确地对番茄枯萎病菌Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici（FOL）和番茄颈腐根腐病菌F. oxysporum f. sp. radicis-lycopersici（FORL）进行检测，基于尖孢镰刀菌F. oxysporum多聚半乳糖醛酸外切酶基因pgx4的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）位点，设计FORL、FOL生理小种1（FOL-R1）、2（FOL-R2）和3（FOL-R3）的竞争性等位基因特异性PCR-SNP（kompetitive allele specific PCR-SNP,KASP-SNP）引物，建立番茄颈腐根腐病菌和番茄枯萎病菌KASP-SNP检测技术，并通过与常规PCR比对及ITS与pgx4序列分析对该检测技术的可靠性进行验证。结果显示，在FORL、FOL-R1、FOL-R2和FOL-R3中存在35个变异SNP位点，设计出18对KASP-SNP引物，筛选出FORL＿KASP、FOLrace1＿KASP、FOLrace2＿KASP和FOLrace3＿KASP共4对分型清晰的引物。KASP-SNP技术对FORL、FOL-R1和FOL-R2的检测阳性率达100.00%，对FOL-R3的检测阳性率为92.68%；常规PCR方法对FOL-R1和FOL-R3的检测阳性率也达100.00%，而对FORL的检测阳性率只有59.09%。表明所建立的KASP-SNP技术可用于FOL-R1、FOL-R2、FOL-R3和FORL的快速、准确检测。
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