【摘 要】
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各质谱厂商通常使用不同的软件进行蛋白鉴定和定量,导致获得的数据和结果的通用性不佳。另外,目前蛋白质定量的准确性仍有提升空间。因此,开发一个标准化、自动化且定量更准
【机 构】
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蛋白质组学国家重点实验室,复旦大学生命科学学院
【基金项目】
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国际科技合作项目《蛋白质组信息学关键技术及分析系统研发》（2014DFB30010）,青年科学基金项目《利用高解析度质谱数据进行中低丰度蛋白质无标定量的研究》（31200992）资助
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各质谱厂商通常使用不同的软件进行蛋白鉴定和定量,导致获得的数据和结果的通用性不佳。另外,目前蛋白质定量的准确性仍有提升空间。因此,开发一个标准化、自动化且定量更准确的蛋白质定量流程具有现实意义。采用肽段保留时间对齐和回归技术,可有效地减少中低丰度肽段鉴定信息缺失带来的影响,提高中低丰度蛋白的定量能力。一个综合考虑信号峰宽分布、保留时间分布以及肽段同位素模式分布等因素的肽段筛选器,可以有效地过滤掉不适宜定量的肽段信号,使肽段离子流色谱（XIC）峰定量面积的计算更为准确。该流程由数据开源转换、保留时间对齐与回
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