基于最优化方法的组织特异代谢系统研究

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最优化方法在代谢系统中有着广泛的应用,它为研究基因型-表型关系,优化代谢工程,以及辅助药物设计等提供了一个有力的基础.当前,新兴的组织特异代谢系统极大地推动了这一领域的研究.在本论文中,我们通过最优化方法进行组织特异代谢系统(人体肾脏)的全面研究.该模型包含276个基因,340个代谢物和443个代谢反应,在简短地讨论了该模型的拓扑特征之后,我们基于最优化方法执行了多种仿真学习,包括流平衡分析,最小化代谢调节,流量变化分析,鲁棒性分析,均匀随机抽样,等.本文的预测结果可以用于在人体肾脏代谢的研究中指导实验设计.
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