ITS2条形码序列对茜草科黎药植物的鉴定

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目的利用DNA条形码技术通过ITS2序列对海南茜草科黎药植物进行快速鉴定。方法对样本的核基因ITS2片段进行PCR扩增并双向测序,所得序列经CodonCode Aligner拼接后,利用MEGA5.0软件进行数据分析,并构建聚类树。从ITS2网站上获得ITS2二级结构信息,利用TAXON DNA软件分析序列种内、种间变异并作barcoding gap分析。结果构建的系统树各个种不同样本均分别聚在一起,表现出单系性;各ITS2二级结构种内无明显差异;种间存在明显差异;基于ITS2序列的barcoding gap图显示种内变异和种间变异存在明显的barcoding gap。结论 ITS2序列可以作为DNA条形码对海南茜草科黎药植物进行快速鉴定。
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