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脉冲到达时间（TOA）是脉冲星导航解算中的基本观测量，其精度直接影响着脉冲星导航精度。脉冲到达时间延迟一般通过将观测脉冲轮廓与标准轮廓进行互相关计算求得，但该算法依赖于脉冲轮廓的时间分辨率。本文研究了一种基于频域傅里叶变换（FFT）的脉冲TOA求解算法，推导了相应计算公式，并采用仿真数据和RXTE卫星实测数据进行了试验分析。研究结果表明，基于FFT的算法得到了准确的脉冲轮廓时间延迟，能应用于空间实测数据处理中，但该方法对噪声水平比较敏感。