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目的采用连续横断面调查和BED-捕获酶免疫试验(BED-capture enzyme immunoassay,BED-CEIA)估算重庆市男男性行为人群(MSM)2009年艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)的发病率,分析流行趋势,讨论该方法应用于MSM人群的效率。方法利用"滚雪球"和同伴推动抽样方法(RDS),采用标准化问卷收集行为信息并采集血样,对HIV抗体确认阳性者采用BED-CEIA方法检测HIV-1新近感染,根据标准公式和2种校正公式,对该人群2009的发病率按不同年龄、寻找性伴方式、学历、收入状况等进行分层计算,与历年结果进行比较分析。结果共招募MSM志愿者942名,平均年龄为(26.32±7.11)岁,大专及以上学历者598人(63.48%);共发现HIV感染者142人,BED检测为新近感染者62人。重庆市MSM人群2009年HIV-1年发病率为15.43%(95%CI:11.59～19.28),较2008年增长了64.49%,与过去3年有显著性差异。21～30岁年龄组年发病率为15.03%(95%CI:10.42～19.42),通过网络寻找性伴组的年发病率为14.69%(95%CI:10.14～19.24),大专及以上学历组年发病率为13.74%(95%CI:9.25～18.23)。结论重庆市MSM人群HIV-1发病率呈快速上升趋势,2009年发病率校正之后的绝对值与前三年比较,结果有显著性差异;不同的校正公式得到的结果没有显著性差异,但与估计感染率之间存在令人深思的矛盾现象。