转录组测序分析吲哚美辛对小鼠小肠类器官的影响

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目的

探讨吲哚美辛对小鼠小肠类器官转录组的影响。

方法

采用四唑盐比色法检测吲哚美辛对小肠类器官存活率的影响,Illumina Hiseq测序技术筛选吲哚美辛组与对照组小肠类器官之间的差异表达基因,并对差异表达基因进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能注释与富集分析。

结果

四唑盐比色法检测结果显示100,250,300,400,500 μM吲哚美辛作用于小鼠小肠类器官48 h后的存活率分别为80.34%,70.17%,61.94%,54.38%,42.22%。250 μM吲哚美辛作用于小鼠小肠类器官24 h、48 h、72 h后的存活率分别为80.56%,70.17%,59.30%。GO富集分析发现在细胞组分分类上,差异表达基因主要富集在微体与过氧化物酶体(P<0.01),在分子功能组上,氧化还原活性、谷胱甘肽转移酶、羧酸结合是显著富集的类型(P<0.01),有机酸代谢过程、含氧酸代谢过程与羧酸代谢过程是显著富集的GO生物过程(P<0.01)。KEGG富集分析发现差异表达基因显著富集在化学致癌作用、异源物质细胞色素P450代谢、细胞色素P450药物代谢、PPAR信号通路(P<0.01)。

结论

吲哚美辛以时间与浓度依赖性方式抑制小鼠小肠类器官的增殖。小肠类器官可能存在抗氧化应激作用抵御吲哚美辛引起的小肠损伤。逆转氧化应激有望成为非甾体抗炎药小肠损伤的治疗靶点。

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