【摘 要】
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为了研究铁皮石斛菌根共生系统的Long noncoding RNA(lncRNA)调控机制,采用高通量测序方法对铁皮石斛栽培苗和组培苗lncRNA进行检测,并分析显著差异转录本。结果显示:2组4个样品共测出26543个lncRNA转录本,在实验组中显著上调的有186组,显著下调的有183组。GO富集分析共获得1275组数据,具有显著性差异的基因数最多的是细胞核;KEGG富集分析共获得20条通路,其
【基金项目】
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浙江省重点研发计划项目(2015C02030);
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为了研究铁皮石斛菌根共生系统的Long noncoding RNA(lncRNA)调控机制,采用高通量测序方法对铁皮石斛栽培苗和组培苗lncRNA进行检测,并分析显著差异转录本。结果显示:2组4个样品共测出26543个lncRNA转录本,在实验组中显著上调的有186组,显著下调的有183组。GO富集分析共获得1275组数据,具有显著性差异的基因数最多的是细胞核;KEGG富集分析共获得20条通路,其中富集程度最显著的是苯丙素生物合成途径。选取参考基因已知的转录本,得到10组显著上调的lncRNA,10组显著下调的lncRNA,共涉及5条富集通路,分别在淀粉和蔗糖代谢途径和苯丙素生物合成途径中上调,在植物激素信号转导和内质网中的蛋白质加工途径中下调,剪接体途径中则同时存在表达上调和下调。以上结果可为进一步研究铁皮石斛菌根共生机制提供参考,对相关功能进行预测。
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