肠道病毒71型3D蛋白关键氨基酸突变对病毒增殖的影响

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的

研究肠道病毒71型(enterovirus 71, EV71)中3D蛋白关键氨基酸突变对病毒增殖的影响,并根据3D三级结构模型推断突变影响病毒增殖能力的可能机制。

方法

以强毒株SDLY107构建的质粒pMD19T-SDLY107-EGFP为模板,利用定点突变和反向遗传学技术构建病毒突变株,对突变株增殖特性进行测定。同时对3D蛋白三级结构进行预测,根据3D蛋白的结构域功能特性推测突变影响病毒增殖能力的可能机制。

结果

经过双酶切鉴定和病毒基因测序证实已成功构建两株突变株病毒:EGFP-EV-A71(S37N)和EGFP-EV-A71(R142K)。两株突变株在RD细胞中的增殖速率均明显弱于亲本毒株。3D蛋白三级结构预测模型显示3D蛋白由"手指(finger)"、"拇指(thumb)"和"手掌(palm)"三个结构域构成握杯状右手结构,S37N位于"拇指"结构域,R142K位于"手指"结构域,而"拇指"和"手指"结构域对3D聚合酶的活性以及蛋白的稳定性具有重要影响。

结论

S37N和R142K突变降低了EV71的复制能力,这两个突变可能是通过改变3D蛋白聚合酶活性和结构域之间的相互作用,进而影响EV71病毒增殖。

其他文献
目的探索依托泊苷(VP-16)对人类免疫缺陷病毒(humanimmunodeficiencyvirus-1,HIV-1)潜伏感染的激活作用并研究其潜在的分子机制。方法将HIV-1潜伏感染细胞系J-Lat分为二甲基亚砜(DMSO)处理组、VP-16处理组及伏立诺他(SAHA)处理组,利用流式细胞技术检测细胞绿色荧光蛋白(greenfluorescentprotein,GFP)阳性比例,评估高浓度VP-16对HIV-1潜伏感染的激活效率;通过流式细胞技术检测VP-16在不同作用浓度及不同作用时间下对HIV-1
目的探讨CXC趋化因子配体10(C-H-Cmotifchemokineligand10,CXCL10)基因rs56061981单核苷酸多态性与乙型肝炎病毒(hepatitisBvirus,HBV)相关慢加急性肝衰竭(hepatitisBvirusrelatedacute-on-chronicliverfailure,HBV-ACLF)发病风险及病情严重程度的关系。方法收集86例HBV-ACLF和42例慢性乙型肝炎(chronichepatitisB,CHB)患者入院时的血液标本。常规方法检测患者血清丙氨酸
目的探讨HIV感染急性期(acuteHIVinfection,AHI)和慢性期(chronicHIVinfection,CHI)外周血滤泡辅助性T细胞(circulatingTfollicularhelpercell,cTfh)的动力学变化及对B细胞分化的影响。方法从北京佑安医院男男性行为高危筛查队列中筛选HIV感染者和HIV阴性的健康对照者(healthycontroller,HC)。采用流式分析方法,分别检测AHI、CHI和HC组cTfh细胞和B细胞亚群的比例和数量并进行比较分析。结果与HC相比,cT
目的了解2016—2018年星状病毒基因型流行情况,为防治星状病毒感染引起的疾病提供实验依据。方法用星状病毒实时荧光PCR试剂盒进行星状病毒阳性核酸的筛查。用星状病毒特异性引物Mn289/270进行RT-PCR扩增,阳性产物回收纯化并直接测序,用Clustal和MEGA3.0生物软件对星状病毒序列进行序列比对和系统进化分析。结果496例儿童腹泻中病毒性腹泻136例,占17.4%,其中17例检测到星状病毒,占3.4%;男性多于女性;年龄分布均是5岁以下儿童,而且小于1岁的儿童12例,占70.58%(12/1
目的探讨丁型肝炎患者的流行状况及临床特征。方法筛查2010年1月1日至2020年12月31日陆军军医大学西南医院感染病研究所HBsAg阳性病例832144例,进行HDV-Ag和(或)HDV-IgG检测,共13585例。最终收集157例丁型肝炎患者的资料,年龄22~85(53±13)岁,其中男性122例,女性35例。对丁型肝炎的流行状况、临床特征及随访28天的转归、及其影响因素进行分析。结果近10年间,丁型肝炎筛查率仅1.6%(13585/832144),2011年筛查率最高,达4.13%(962/2328
目的确定肠道病毒A71型(Enterovirus-A71,EV-A71)感染人扁桃体上皮细胞后miRNA表达谱的改变。方法EV-A71以感染复数为1感染人扁桃体上皮细胞6h后,采用Trizol提取总RNA,构建小RNA文库,在IlluminaNextSeq500平台进行高通量测序,处理数据后确定差异表达的已知和新型miRNA种类及其靶基因,进行基因本体和信号途径分析;使用psRNATarget预测具有潜在结合EV-A71基因组的差异表达的miRNA种类。实时定量RT-PCR检测差异表达miRNA的变化倍数
目的分析福建省2014—2019年不同基因型麻疹野病毒流行情况,为制定后续麻疹防控策略,完成消除麻疹目标提供参考。方法收集福建省2014—2019年麻疹发病监测数据及各地市上送的麻疹疑似病例咽拭子样本,采用逆转录-聚合酶链反应扩增麻疹病毒N蛋白羧基端450个核苷酸序列,对扩增产物进行序列鉴定和分析。结果2014—2019年福建省共报告疑似麻疹病例1102例,年发病率为0.47/10万;实验室共接收咽拭子标本884份,获得除疫苗株外麻疹病毒N蛋白羧基端450个核苷酸序列179条,其中110条为H1基因型麻疹
目的分析山东省两地区影响尖锐湿疣(condylomaacuminatum,CA)患者复发的危险因素及人乳头瘤病毒(humanpapillomavirus,HPV)型别分布。方法2019年8月至2020年12月在山东省济南市和济宁市共三家医院对CA患者开展匿名问卷调查并采集样本进行HPV分型检测,采用多因素二元Logistic回归分析影响CA复发的危险因素,HPV分型采用PCR-反向点杂交法进行检测。结果共收集问卷653份,有效问卷占98.77%(645/653)。174例患者出现复发,复发率26.98%。
目的分析北京地区呼吸道感染住院儿童人博卡病毒1型(humanbocavirus1,HBoV1)的流行病学特征,阐明遗传进化特点。方法采用real-timePCR方法对2017—2019年北京友谊医院呼吸道感染住院患儿的2848份鼻咽抽吸物样本进行HBoV1核酸检测,结合临床信息进行流行病学分析;利用巢氏PCR方法扩增HBoV1的NP1和VP1基因,分析序列同源性;构建VP1的最大分支可信度树和种群进化图,进行时间进化分析。结果2848份样本中检出HBoV1阳性样本90份,感染率为3.16%,5岁以下患儿居
目的了解兰州市住院严重急性呼吸道感染(severeacuterespiratoryinfection,SARI)病例常见呼吸道病毒病原谱及流行病学特征,为兰州市SARI病例的防控和治疗提供参考依据。方法收集2011年1月至2020年12月兰州大学第一医院SARI病例的咽拭子、痰液及少量肺泡灌洗液样本2571份,同时收集病例资料和临床信息,将监测人群分为5个年龄组(0岁~、1岁~、5岁~、15岁~、60岁~),采用多重Real-timePCR法对常见呼吸道病毒进行核酸检测。结果2571份样本中共检出9种病毒