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有假说认为，猪是禽类、人类以及猪流感病毒发生重配的混合器，它在形成能造成人类宿主广泛流行的新型流感病毒方面具有重要作用。近来发生在墨西哥、美国以及其它地区的猪源性甲型H1N1流感病毒的广泛传播就强调了这种重配病毒对世界公共卫生体系的破坏力。在1930年到1990年间，在猪群里流行的猪流感病毒主要是经典的甲型H1N1猪流感病毒，一直保持相对稳定。