【摘 要】
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干扰素是一类具有抗病毒、抗肿瘤、免疫调节等生物学功能的细胞因子。干扰素-α属于Ⅰ型干扰素,由Z染色体连锁基因IFNA编码。利用PCR技术,对雁形目8种鸟类IFNA进行扩增并测序
【机 构】
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安徽师范大学生命科学学院生物信息研究所;
【基金项目】
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安徽高校自然科学研究重大项目(KJ2016SD22);安徽省高等教育振兴计划重大教学改革项目(2015zdjy035);安徽师范大学大学生创新创业训练计划项目(国家级,201510370068);安徽师范大学本科生优秀毕业论文培育计划项目(pyjh2015316)
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干扰素是一类具有抗病毒、抗肿瘤、免疫调节等生物学功能的细胞因子。干扰素-α属于Ⅰ型干扰素,由Z染色体连锁基因IFNA编码。利用PCR技术,对雁形目8种鸟类IFNA进行扩增并测序;联合GenBank中释放的数据,利用生物信息学方法对17种鸡雁类IFNA的序列特征、进化速率、编码蛋白的理化性质等进行分析,并使用MP、ML和BI 3种方法构建进化树以探讨其系统发育意义。结果表明大多数鸡雁类IFNA序列中存在CpG island,且该基因编码的干扰素-α为不稳定的亲水性分泌蛋白;与线粒体nad2、cytb和atp6 3种基因相比,鸡雁类IFNA的dN/dS值较高,进化速率较快。此外,在鸡雁小纲类群中发现了IFNA有1个正选择位点。分子系统发育分析表明IFNA带有部分系统发育信息,且多基因联合构建的分子树能较好地反映物种的进化历史。
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