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用16S rRNA部分序列对Williams数值分类系统所包含的链霉菌属种或种群进行系统进化分析。以包含16S rRNA 基因V-2高变区在内的120 bp长核苷酸序列所作的系统进化树表明：这些链霉菌可分为34个簇，其中大簇5个（包括27～85株菌株）；中等大小簇3个（包括9～12株菌）；小簇8个（包括2～6株菌）；单成员簇19个。结果同时表明，Williams数值分类系统中根据形态、生理、生化特征进行归类而得的种或种群内存在较大异质性。