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随着FPGA规模大幅度提高,配置数据的规模也迅速增加,从而导致FPGA重构时间的增加,并使得存储多个配置的存储器成为基于FPGA的嵌入式系统成本的最大因素.针对Virtex系列FPGA配置数据的结构特点,提出了一种基于LZW改进的配置数据压缩算法,并通过数字信号处理领域和数字通信领域的5个常用模块进行验证,取得了显著的压缩效果.