溴代胞嘧啶对三螺旋DNA稳定性的影响

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研究了三螺旋DNA中胞嘧啶被5-溴胞嘧啶取代后的稳定性问题.通过建立CGC,CGBrC,BrCGC和BrCGBrC 4种模型,并采用 Insight Ⅱ软件包中的 Discover 程序进行计算模拟,发现用5-溴胞嘧啶取代三螺旋DNA分子中的胞嘧啶后,整个分子的稳定性有所降低.同时,当用5-溴胞嘧啶取代三螺旋DNA不同链上的胞嘧啶时,被取代链的碱基堆积能显著增高,导致分子链内稳定性降低,但被取代链和相邻链间相互作用能有所降低,使得链间作用趋向稳定.
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