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全相位谱分析能够很好地抑制频谱泄漏、优化系统性能，其关键技术在于对数据进行全相位预处理。将这一技术运用于HHT求解瞬时频率中，提出了一种全相位HHT的瞬时频率测量算法，分析了全相位预处理和HHT求解瞬时频率的算法，将信号首先进行全相位预处理，然后用HHT算法求解信号的瞬时频率。这种算法是一种优化算法性能的算法，不会过多增加系统的计算量。通过对一非平稳信号分析，验证了基于全相位HHT的瞬时频率方差更小，具有更高的精确性。