【摘 要】
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为了高效鉴定和数字化管理糜子(Panicum miliaceum L.)资源,创建糜子种质分子身份证,以来源于北方春糜子区的21份糜子资源作为试验材料,用14个高基元(四碱基重复)SSR构建分子身份证,利用PowerMarker 3.25、PopGen 1.32软件计算遗传多样性参数,利用ID Analysis 4.0进行引物组合优化.结果表明,14对引物中8对可作为候选核心引物,8对引物共检测出等位变异24个;有效等位变异(Ne)为2.4845～2.9712,均值为2.7194;Shannon多样性指数
【机 构】
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山西农业大学 农学院,山西 太谷 030801;山西农业大学 农业基因资源研究中心/农业农村部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室/杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室,山西 太原 0300
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为了高效鉴定和数字化管理糜子(Panicum miliaceum L.)资源,创建糜子种质分子身份证,以来源于北方春糜子区的21份糜子资源作为试验材料,用14个高基元(四碱基重复)SSR构建分子身份证,利用PowerMarker 3.25、PopGen 1.32软件计算遗传多样性参数,利用ID Analysis 4.0进行引物组合优化.结果表明,14对引物中8对可作为候选核心引物,8对引物共检测出等位变异24个;有效等位变异(Ne)为2.4845～2.9712,均值为2.7194;Shannon多样性指数(I)为0.9877～1.0937,均值为1.0437;观测杂合度(Ho)为0.5263～0.8333,均值为0.7306;期望观测杂合度(He)为0.6121～0.6814,均值为0.6483;Nei\'s基因多样性指数(Nei)为0.5975～0.6634,均值为0.6310;多态性信息含量(PIC)为0.5933～0.7608,均值为0.6905.14对核心引物中剔除6对(RYW2、RYW3、RYW4、RYW7、RYW13和RYW14)与其他引物相似系数过高的引物,用8对引物组合(RYW9、RYW10、RYW8、RYW12、RYW6、RYW5、RYW11和RYW1)可将21份材料区分.8对核心引物构建了21份糜子资源的字符串和条形码,在线二维码生成器中输入各糜子的名称、统一编号、生态区、来源、字符串等信息得到糜子的二维码DNA分子身份证.
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