【摘 要】
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目的 对国内现在使用的Shanghai-191(S-191)疫苗株进行全基因组测序,针对国内已经分离出的毒株,分析它们与疫苗株的核酸序列差异以及流行特征.方法 利用RT-PCR的方法分段扩增S-191疫苗株的全基因并测序,从GenBank中获得全球24条麻疹全基因序列和211株中国各省分离到的麻疹流行株以及WHO各基因型参考株的N基因C端456个核苷酸序列,计算麻疹序列13个编码区和非编码区的突变
【机 构】
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目的 对国内现在使用的Shanghai-191(S-191)疫苗株进行全基因组测序,针对国内已经分离出的毒株,分析它们与疫苗株的核酸序列差异以及流行特征.方法 利用RT-PCR的方法分段扩增S-191疫苗株的全基因并测序,从GenBank中获得全球24条麻疹全基因序列和211株中国各省分离到的麻疹流行株以及WHO各基因型参考株的N基因C端456个核苷酸序列,计算麻疹序列13个编码区和非编码区的突变率,分析病毒株和疫苗株基因型和遗传距离,构建基因亲缘性关系树.结果 获得S-191疫苗株的全基因序列并递交GenBank收录,进化树分析表明大部分流行株为H1基因型.各省流行株与S-191相比遗传距离为6.7%～8.2%.突变率分析显爪非编码区的突变率明显高于编码区,编码区中N基因的突变率最大.结论 本研究表明,中国大陆的麻疹病毒流行株以H1基因型为主,不存在明显的地域流行差异,在时间上也没有明显的突变积累特征.S-191疫苗株与近年来的麻疹流行株在遗传距离上差异较大,其保护作用需做进一步追踪探讨。
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