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一种基于支持向量机的蛋白质结构域边界预测方法
一种基于支持向量机的蛋白质结构域边界预测方法
来源 :吉林大学学报(理学版) | 被引量 : 3次 | 上传用户:enjoy12_east
【摘 要】
:
提出一种基于支持向量机学习蛋白质结构域的边界预测方法.在分析多序列比对结果的基础上,定义了几种能够直接或间接反映蛋白质结构属性及结构域信息的新方法.结果表明,蛋白质序列信息预测边界信号的正确识别率达85%以上,具有较好的泛化能力.
【作 者】
:
邹淑雪
黄艳新
李艳文
周春光
【机 构】
:
吉林大学计算机科学与技术学院,东北师范大学计算机学院
【出 处】
:
吉林大学学报(理学版)
【发表日期】
:
2008年05期
【关键词】
:
蛋白质结构域
序列
支持向量机
生物信息学
protein domains
sequence
support vector machine
bioi
【基金项目】
:
基金项目:国家自然科学基金(批准号:60433020,60673099,60773095)
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提出一种基于支持向量机学习蛋白质结构域的边界预测方法.在分析多序列比对结果的基础上,定义了几种能够直接或间接反映蛋白质结构属性及结构域信息的新方法.结果表明,蛋白质序列信息预测边界信号的正确识别率达85%以上,具有较好的泛化能力.
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