【摘 要】
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目的寻找有效的肿瘤标记物是目前研究的热点。通过单细胞测序方法明确三阴性乳腺癌(TNBC)组织中巨噬细胞的标记基因,并分析标记基因可能参与的生物学过程和其中的关键基因。
【机 构】
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徐州医科大学研究生学院,徐州医科大学附属医院普外科
【基金项目】
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江苏省自然科学基金(BK20191153)
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目的寻找有效的肿瘤标记物是目前研究的热点。通过单细胞测序方法明确三阴性乳腺癌(TNBC)组织中巨噬细胞的标记基因,并分析标记基因可能参与的生物学过程和其中的关键基因。方法运用GEO数据库下载数据集GSE118389获得所需的单细胞数据,并利用PCA和t-SNE的降维,获得15个亚群细胞,进而获得不同亚群细胞的标记基因。再对巨噬细胞的标记基因进行基因本体论和京都基因与基因组百科全书富集分析,分析这些基因可能参与的生物学过程。最后通过构建蛋白-蛋白互作网络,寻找各个网络中的关键基因,利用Kaplan-Meie
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