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摘要:为了证实南疆鸡群感染了H9N2亚型AIV,对2个鸡场6份疑似H9N2亚型AIV感染病鸡组织病料,进行H9N2亚型AIV HA和NA基因部分片段扩增、测序及序列分析。结果表明,南疆该鸡场感染了H9N2亚型AIV。因此,南疆地区养殖场应重视该病的预防和控制。
关键词:南疆;禽流感;H9N2亚型
中图分类号: S858.31 文献标志码: A文章编号:1002-1302(2015)11-0303-03
收稿日期:2014-11-03
基金项目:国家自然科学基金(编号:31460655);华中农业大学塔里木大学科研联合基金(编号:HNTDLH1404);新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室开放课题(编号:HS2014011);新疆生产建设兵团博士资金(编号:2012BB023);塔里木大学高教研究项目(编号:TDGJ1409);国家大学生创新创业训练计划(编号:20140757023)。
作者简介:刘永宏,男,内蒙古呼和浩特人,博士,研究方向为传染病与免疫病理学。E-mail: lyhdky@126.com。
通信作者:赵丽。流感病毒(influenza virus,IV)是正黏病毒科流感病毒属成员,根据病毒粒子中NP和M蛋白的抗原差异,分为甲(A)、乙(B)和丙(C)3型,其中A型流感病毒的抗原变异性最强,常引起世界性大流行。A型流感病毒基因组为8个分节段负链RNA,编码12~13种病毒蛋白。A型流感病毒根据2种表面蛋白血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)的抗原性特点分为不同的亚型,已证明有16个HA亚型和9个NA亚型[1-5]。HA和NA基因可作为RT-PCR方法的靶序列基因,用于AIV的亚型鉴别。
1966年Homme等分离到第1株H9N2亚型AIV[6],此后H9N2亚型AIV在世界各地广泛流行。1988年,香港在亚洲范围内第1次从陆禽中分离到3株H9N2亚型AIV[7]。1994年陈伯伦等分离到中国第1株H9N2亚型AIV[8],后来发现H9N2亚型AIV在我国各地普遍存在,2009年新疆报道从野生灰雁中分离到H9N2亚型AIV[9],新疆也报道了个体养殖户麻花鸡感染H9亚型AIV[10]。H9N2亚型AI多呈低致病性感染,但由于分布广泛且呈蔓延之势,有重组为强毒的可能性,因此给养禽业造成的威胁不容忽视。本研究对南疆发病疑似H9N2亚型AIV感染鸡组织病料,进行RT-PCR扩增HA和NA基因部分片段,并测序确定其亚型。
1材料与方法
1.1材料
1.1.1病料6份病鸡组织病料,来自2013年南疆地区2个鸡场,-20 ℃保存备用。
1.1.2主要试剂Trizol invitrogenTM(编码.:15596-026),购自Invitrogen生物工程有限公司;TaKaRa RNA PCR Kit(AMV)Ver.3.0(编码.:DRR019A),Premix Taq Version2.0(编码.:D331A)和DNA Marker 2000,购自宝生物工程(大连)有限公司;TIANgel Midi Purification Kit(编码.:DP209),购自天根生化科技(北京)有限公司等。
1.1.3引物按照引物设计原则,利用Primer Premier 5.0分子生物学软件,以GenBank数据库中国内外已发表的H9N2亚型AIV的HA和NA基因全序列为参照设计特异性引物。引物序列为HA:5′-TGCAACAAATCTGGGACA-3′,5′-AGGCGACAGTCGAATAAA-3′;NA:5′-TTGCGACAA-TATGTTTCC-3′,5′-GCTATTTGAAGTCCACCAC-3′。引物由生工生物工程(上海)有限公司合成,预期大小约为 1 420、1 270 bp。
1.1.4仪器PCR仪:TC-5000,比比科技有限公司;小型高速冷冻离心机:R134a,密封式制冷系统;电泳仪:DYY-12,北京市六一仪器厂;紫外分析仪:JY02S,北京君意东方电泳仪设备有限公司等。
1.2方法
1.2.1总RNA提取从病鸡组织病料中提取总RNA,按Trizol invitrogenTM试剂盒说明书操作。
1.2.2RT-PCR反应总RNA按照TaKaRa RNA PCR Kit(AMV)Ver.3.0试剂盒,利用已设计的特异性引物,进行一步法扩增HA或NA基因片段,退火温度均为51 ℃。cDNA同时加HA和NA特异性引物,作为阴性对照。
1.2.3PCR产物纯化回收取HA或NA基因片段RT-PCR扩增产物电泳切胶后,按照TIANgel Midi Purification Kit试剂盒说明进行回收纯化。
1.2.4测序将纯化产物标记后送生工生物工程(上海)有限公司测序,测序引物为HA或NA基因扩增引物。
1.2.5序列分析利用BLAST在线平台分析与本研究获得的HA或NA基因片段同源性较高的序列,判断本研究毒株的亚型。
2结果与分析
2.1AIV HA和NA基因片段RT-PCR扩增结果
本研究的6例样品,根据HA和NA特异性引物RT-PCR扩增相应基因片段,结果均为阳性,2个片段产物均与预期扩增长度一致,阴性对照成立(图1)。
2.2BLAST在线比对结果
本研究将6例样品经RT-PCR、胶回收纯化和测序得到HA和NA部分基因序列,利用BLAST在线平台分析,在线结果显示,与其同源性由高到低的100个序列均为H9或N2。
3结论与讨论
禽流感分为高致病性禽流感和低致病性禽流感。高致病性禽流感主要由H5或H7亚型AIV引起,发病率和病死率均高,全球对其高度重视。另外,全球人感染H5N1亚型AIV病例至少649例,死亡385例,病死率达到59.32%[11]。2013年,中国十几个城市百余人感染H7N9亚型AIV,死亡40余人,研究表明,H7N9流感病毒能够发生有限的人传人[12]。因此,全球对高致病性禽流感更加重视。低致病性禽流感往往致死率较低,表现为轻度呼吸道症状和产蛋率下降等,而未被重视。对养禽业危害最严重的低致病性禽流感亚型主要为H9N2,1996—2000年,中国H9N2亚型AI的发病率占AI总发病率的93.89%[13]。1999年以来,H9N2亚型AIV感染人事件的多次发生,严重威胁了世界公共卫生[14]。另外,AIV变异性较强较快,当2种低致病性毒株同时感染鸡,可能会发生毒株变异和重组,产生强毒株,导致鸡群遭受严重损伤。因此,H9N2亚型AI应该被高度重视。 目前,中国对禽流感的防制措施主要是疫苗接种,但现在不同公司选用的H9N2亚型疫苗株不同,导致疫苗株繁多,某些地区不清楚当地流行株是什么,不清楚选用哪个毒株预防效果最好,且免疫程序混乱。此外,养殖户对禽流感,尤其低致病性禽流感认识不够,防疫意识不够,对免疫监测更是一无所知。所以,导致H9N2亚型AI在国内控制效果一直不能令人满意。2009—2010年,在新疆部分地区蛋鸡、肉鸡、家养水禽的养殖场,H9免疫抗体合格率为62.4%~100.0%,20%~33%蛋鸡场存在100%的零效价现象,活禽市场H9抗体合格率为21.70%~67.14%[15]。2013年,发现新疆和田县未免疫H9疫苗养殖户HI抗体感染率为35.29%,意味着和田县存在H9亚型禽流感发病的风险[16]。
2009—2011年,新疆野鸟检出了禽流感H1~H16全部亚型,不同野鸟各亚型检出率不同,其中野鸭类H9检出率最高[17]。野鸟带毒却很少发病或死亡,往往成为重要的病原携带者,随着候鸟的迁徙,与留鸟及家禽的接触,而将疫情进一步扩散。因此,AI的暴发流行除了与禽及禽产品贸易流通因素有关之外,野生鸟类被认为是最有可能的传染来源之一。研究结果表明,湿地和水栖野鸟,如雁形目和鸻形目是AIV主要的天然储存者[17]。新疆湿地资源丰富,每年数以万计的迁徙性鸟类途径新疆,并在南北疆地区栖息和繁殖。因此,野生鸟类的迁徙对新疆地区乃至我国AI的防控造成潜在的威胁和巨大的压力。1994年,新疆石河子报道了国内外首次从鸡中分离出的H14亚型禽流感分离株[18],证实了新疆AIV毒株的丰富。
近年来,不同动物流感病毒跨越种间屏障感染的报道越来越多,目前已经从多种家禽,如水禽、猪、马、狗、猫科动物、海洋哺乳动物以及人类中分离到AIV。猪是AIV“禽—猪—人”传播链的重要中间宿主。2009—2011年,新疆报道猪、狗H9亚型抗体阳性[19],加之猪、狗与人类的密切关系,这无疑对新疆地区流感的防控构成一定的潜在威胁,对流感的发生与流行发出了重要的预警。
禽流感对新疆乃至中国潜在威胁巨大,提醒相关人群应足够重视该病的防控[20-21]。本研究根据流行病学调查、临床症状检查和病鸡剖检,疑似南疆2个鸡场鸡群感染低致病性禽流感。影响我国养禽业的低致病性AIV主要为H9N2亚型,针对已发表的H9N2亚型AIV毒株序列,设计扩增HA和NA基因部分片段的特异性引物,并将扩增产物纯化测序分析。本研究所得的HA基因片段序列,经BLAST在线分析,与其同源性由高到低的100个序列,均为H9亚型;本研究所得的NA基因片段序列,经BLAST在线分析,与其同源性由高到低的100个序列,均为N2亚型。研究结果表明,2个鸡场鸡均感染H9N2亚型AIV。虽然2个鸡场常年发生类似症状疾病,但附近相似饲养管理、饲养技术、饲养环境和免疫标准条件下饲养的和田黑鸡,通过多次试验并未检出感染H9N2亚型AIV。和田黑鸡是否具有H9N2亚型AIV抗性,需要进一步观察研究,如果研究证实,和田黑鸡可能会成为抗AIV研究的良好材料。
参考文献:
[1]殷震,刘景华. 动物病毒学[M]. 2版.北京:科学出版社,1997:704-735.
[2]侯云德. 分子病毒学[M]. 北京:学苑出版社,1990:313-326.
[3]郭元吉,程小雯. 流行性感冒病毒及其实验技术[M]. 北京:中国三峡出版社,1997.
[4]Saif Y M. 禽病学[M]. 11版.苏敬良,高福,索勋,译. 北京:中国农业出版社,2005:147-166.
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[8]陈伯伦,张泽纪,陈伟斌,等. 鸡A型AIV的分离与血清学初步鉴定[J]. 中国兽医杂志,1994,20(10):3-5.
[9]成进,沙依兰古丽,夏俊,等. 一株野生灰雁禽流感H9亚型病毒全基因序列的测定与分析[J]. 中国兽医科学,2012,42(10):1002-1006.
[10]汪萍,沙依兰古丽,成进,等. 麻花鸡混合感染禽流感H9亚型、新城疫的病原分离与鉴定[C]//中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第七届全国会员代表大会暨第十三次学术研讨会论文集:下册,2009:971-973.
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[12]资海荣,李伟,周丹,等. 新型甲型H7N9流感病毒PB1-F2蛋白基因进化和变异分析[J]. 东南大学学报:医学版,2014,33(4):416-421.
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[15]成进,彭晓玲,夏俊,等. 2009—2010年新疆地区家禽禽流感免疫抗体监测与分析[J]. 中国动物检疫,2011,28(7):51-53.
[16]张丽.古力萨伊普罕·热杰甫. 新疆和田县2011—2013年禽流感血清学调查与分析[J]. 新疆畜牧业,2014(7):28-29.
[17]成进,沙依兰古丽,夏俊,等. 2009—2011年新疆雁形目野生鸟类禽流感血清流行病学调查与分析[J]. 中国兽医杂志,2012,48(12):3-6.
[18]汪萍,夏俊,参都哈什,等. 新疆哺乳动物流感病毒血清学监测与分析[J]. 中国预防兽医学报,2013,35(9):767-769.
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关键词:南疆;禽流感;H9N2亚型
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收稿日期:2014-11-03
基金项目:国家自然科学基金(编号:31460655);华中农业大学塔里木大学科研联合基金(编号:HNTDLH1404);新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室开放课题(编号:HS2014011);新疆生产建设兵团博士资金(编号:2012BB023);塔里木大学高教研究项目(编号:TDGJ1409);国家大学生创新创业训练计划(编号:20140757023)。
作者简介:刘永宏,男,内蒙古呼和浩特人,博士,研究方向为传染病与免疫病理学。E-mail: lyhdky@126.com。
通信作者:赵丽。流感病毒(influenza virus,IV)是正黏病毒科流感病毒属成员,根据病毒粒子中NP和M蛋白的抗原差异,分为甲(A)、乙(B)和丙(C)3型,其中A型流感病毒的抗原变异性最强,常引起世界性大流行。A型流感病毒基因组为8个分节段负链RNA,编码12~13种病毒蛋白。A型流感病毒根据2种表面蛋白血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)的抗原性特点分为不同的亚型,已证明有16个HA亚型和9个NA亚型[1-5]。HA和NA基因可作为RT-PCR方法的靶序列基因,用于AIV的亚型鉴别。
1966年Homme等分离到第1株H9N2亚型AIV[6],此后H9N2亚型AIV在世界各地广泛流行。1988年,香港在亚洲范围内第1次从陆禽中分离到3株H9N2亚型AIV[7]。1994年陈伯伦等分离到中国第1株H9N2亚型AIV[8],后来发现H9N2亚型AIV在我国各地普遍存在,2009年新疆报道从野生灰雁中分离到H9N2亚型AIV[9],新疆也报道了个体养殖户麻花鸡感染H9亚型AIV[10]。H9N2亚型AI多呈低致病性感染,但由于分布广泛且呈蔓延之势,有重组为强毒的可能性,因此给养禽业造成的威胁不容忽视。本研究对南疆发病疑似H9N2亚型AIV感染鸡组织病料,进行RT-PCR扩增HA和NA基因部分片段,并测序确定其亚型。
1材料与方法
1.1材料
1.1.1病料6份病鸡组织病料,来自2013年南疆地区2个鸡场,-20 ℃保存备用。
1.1.2主要试剂Trizol invitrogenTM(编码.:15596-026),购自Invitrogen生物工程有限公司;TaKaRa RNA PCR Kit(AMV)Ver.3.0(编码.:DRR019A),Premix Taq Version2.0(编码.:D331A)和DNA Marker 2000,购自宝生物工程(大连)有限公司;TIANgel Midi Purification Kit(编码.:DP209),购自天根生化科技(北京)有限公司等。
1.1.3引物按照引物设计原则,利用Primer Premier 5.0分子生物学软件,以GenBank数据库中国内外已发表的H9N2亚型AIV的HA和NA基因全序列为参照设计特异性引物。引物序列为HA:5′-TGCAACAAATCTGGGACA-3′,5′-AGGCGACAGTCGAATAAA-3′;NA:5′-TTGCGACAA-TATGTTTCC-3′,5′-GCTATTTGAAGTCCACCAC-3′。引物由生工生物工程(上海)有限公司合成,预期大小约为 1 420、1 270 bp。
1.1.4仪器PCR仪:TC-5000,比比科技有限公司;小型高速冷冻离心机:R134a,密封式制冷系统;电泳仪:DYY-12,北京市六一仪器厂;紫外分析仪:JY02S,北京君意东方电泳仪设备有限公司等。
1.2方法
1.2.1总RNA提取从病鸡组织病料中提取总RNA,按Trizol invitrogenTM试剂盒说明书操作。
1.2.2RT-PCR反应总RNA按照TaKaRa RNA PCR Kit(AMV)Ver.3.0试剂盒,利用已设计的特异性引物,进行一步法扩增HA或NA基因片段,退火温度均为51 ℃。cDNA同时加HA和NA特异性引物,作为阴性对照。
1.2.3PCR产物纯化回收取HA或NA基因片段RT-PCR扩增产物电泳切胶后,按照TIANgel Midi Purification Kit试剂盒说明进行回收纯化。
1.2.4测序将纯化产物标记后送生工生物工程(上海)有限公司测序,测序引物为HA或NA基因扩增引物。
1.2.5序列分析利用BLAST在线平台分析与本研究获得的HA或NA基因片段同源性较高的序列,判断本研究毒株的亚型。
2结果与分析
2.1AIV HA和NA基因片段RT-PCR扩增结果
本研究的6例样品,根据HA和NA特异性引物RT-PCR扩增相应基因片段,结果均为阳性,2个片段产物均与预期扩增长度一致,阴性对照成立(图1)。
2.2BLAST在线比对结果
本研究将6例样品经RT-PCR、胶回收纯化和测序得到HA和NA部分基因序列,利用BLAST在线平台分析,在线结果显示,与其同源性由高到低的100个序列均为H9或N2。
3结论与讨论
禽流感分为高致病性禽流感和低致病性禽流感。高致病性禽流感主要由H5或H7亚型AIV引起,发病率和病死率均高,全球对其高度重视。另外,全球人感染H5N1亚型AIV病例至少649例,死亡385例,病死率达到59.32%[11]。2013年,中国十几个城市百余人感染H7N9亚型AIV,死亡40余人,研究表明,H7N9流感病毒能够发生有限的人传人[12]。因此,全球对高致病性禽流感更加重视。低致病性禽流感往往致死率较低,表现为轻度呼吸道症状和产蛋率下降等,而未被重视。对养禽业危害最严重的低致病性禽流感亚型主要为H9N2,1996—2000年,中国H9N2亚型AI的发病率占AI总发病率的93.89%[13]。1999年以来,H9N2亚型AIV感染人事件的多次发生,严重威胁了世界公共卫生[14]。另外,AIV变异性较强较快,当2种低致病性毒株同时感染鸡,可能会发生毒株变异和重组,产生强毒株,导致鸡群遭受严重损伤。因此,H9N2亚型AI应该被高度重视。 目前,中国对禽流感的防制措施主要是疫苗接种,但现在不同公司选用的H9N2亚型疫苗株不同,导致疫苗株繁多,某些地区不清楚当地流行株是什么,不清楚选用哪个毒株预防效果最好,且免疫程序混乱。此外,养殖户对禽流感,尤其低致病性禽流感认识不够,防疫意识不够,对免疫监测更是一无所知。所以,导致H9N2亚型AI在国内控制效果一直不能令人满意。2009—2010年,在新疆部分地区蛋鸡、肉鸡、家养水禽的养殖场,H9免疫抗体合格率为62.4%~100.0%,20%~33%蛋鸡场存在100%的零效价现象,活禽市场H9抗体合格率为21.70%~67.14%[15]。2013年,发现新疆和田县未免疫H9疫苗养殖户HI抗体感染率为35.29%,意味着和田县存在H9亚型禽流感发病的风险[16]。
2009—2011年,新疆野鸟检出了禽流感H1~H16全部亚型,不同野鸟各亚型检出率不同,其中野鸭类H9检出率最高[17]。野鸟带毒却很少发病或死亡,往往成为重要的病原携带者,随着候鸟的迁徙,与留鸟及家禽的接触,而将疫情进一步扩散。因此,AI的暴发流行除了与禽及禽产品贸易流通因素有关之外,野生鸟类被认为是最有可能的传染来源之一。研究结果表明,湿地和水栖野鸟,如雁形目和鸻形目是AIV主要的天然储存者[17]。新疆湿地资源丰富,每年数以万计的迁徙性鸟类途径新疆,并在南北疆地区栖息和繁殖。因此,野生鸟类的迁徙对新疆地区乃至我国AI的防控造成潜在的威胁和巨大的压力。1994年,新疆石河子报道了国内外首次从鸡中分离出的H14亚型禽流感分离株[18],证实了新疆AIV毒株的丰富。
近年来,不同动物流感病毒跨越种间屏障感染的报道越来越多,目前已经从多种家禽,如水禽、猪、马、狗、猫科动物、海洋哺乳动物以及人类中分离到AIV。猪是AIV“禽—猪—人”传播链的重要中间宿主。2009—2011年,新疆报道猪、狗H9亚型抗体阳性[19],加之猪、狗与人类的密切关系,这无疑对新疆地区流感的防控构成一定的潜在威胁,对流感的发生与流行发出了重要的预警。
禽流感对新疆乃至中国潜在威胁巨大,提醒相关人群应足够重视该病的防控[20-21]。本研究根据流行病学调查、临床症状检查和病鸡剖检,疑似南疆2个鸡场鸡群感染低致病性禽流感。影响我国养禽业的低致病性AIV主要为H9N2亚型,针对已发表的H9N2亚型AIV毒株序列,设计扩增HA和NA基因部分片段的特异性引物,并将扩增产物纯化测序分析。本研究所得的HA基因片段序列,经BLAST在线分析,与其同源性由高到低的100个序列,均为H9亚型;本研究所得的NA基因片段序列,经BLAST在线分析,与其同源性由高到低的100个序列,均为N2亚型。研究结果表明,2个鸡场鸡均感染H9N2亚型AIV。虽然2个鸡场常年发生类似症状疾病,但附近相似饲养管理、饲养技术、饲养环境和免疫标准条件下饲养的和田黑鸡,通过多次试验并未检出感染H9N2亚型AIV。和田黑鸡是否具有H9N2亚型AIV抗性,需要进一步观察研究,如果研究证实,和田黑鸡可能会成为抗AIV研究的良好材料。
参考文献:
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