江西2个地方鸡品种MHC B—G座位多态性及生物信息学分析

来源 :扬州大学学报:农业与生命科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:aska1982st
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利用PCR和测序技术获得江西安义瓦灰鸡和东乡绿壳蛋鸡MHC B—G基因全序列,分析其序列多态性,并预测其蛋白质结构与功能。结果表明:瓦灰鸡和东乡绿壳蛋鸡MHC B—G基因全序列大小分别为6427和6107bp,2个鸡品种存在216个变异位点,均为单一多态位点,共缺失624bp。核苷酸多样度(Pi)为0.0372,平均核苷酸差异(K)为216。2个鸡品种MHCB-G蛋白的二级结构以无规则卷曲和延伸链为主,且具有明显的跨膜螺旋结构,疏水性、柔韧性、表面可能性及抗原性预测结果显示,该蛋白具有丰富的B细胞抗原位点
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