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目的 分析不同进化分支肠道病毒71型(EV71)的3D蛋白氨基酸序列的差异,了解潜在毒力相关变异位点.方法 从GenBank和实验室收集C4基因亚型EV71全基因序列,以VP1序列做进化分析,统计分析C4a和C4b两进化分支EV71病毒的3D蛋白氨基酸序列.结果 共收集病毒序列301株C4型EV71毒株,其中C4a序列293株、C4b序列8株.不同进化分支中3D区有22个氨基酸残基分布有统计学意义.结论 两种进化分支C4亚型EV71病毒的3D蛋白,共有22个位点氨基酸变异,其生物学意义有待进一步研究.