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上海中药标准化研究中心于2002年3月由上海市政府批准成立，并由上海中医药大学、中国科学院上海药物研究所、上海市新药研究开发中心共同投资组建，是按现代企业机制运作的事业法人单位。“中心”隶属于上海市科委，实行理事会领导下的主任负责制。中心名誉主任为胡之璧院士，主任为王峥涛教授，常务副主任为周吉燕女士。