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大豆菌核病主要侵染茎秆。7月下旬开始发病，最初茎秆上生有褐色病斑，以后病斑上长出白色棉絮状菌丝体及白色颗粒，后变成黑色颗粒（菌核）。纵剖病株茎秆，可见黑色圆柱形老鼠屎状的菌核。病株常枯死呈白色，故又叫死秧子病、白绢病。向日葵等作物的菌核病与大豆菌核病是由同一种病菌侵染引起的。该病以混杂在种子里的菌核和茎秆内的菌核越冬，第二年萌发菌丝侵染，菌核在土壤中可存活两年。向日葵茬、重茬，低洼地、密度大长势繁茂的大豆发病重；7月底至8月降雨多的年份发病重。