【摘 要】
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目的 利用网络药理学探讨百部发挥止咳作用的活性成分、作用靶点及相关通路,探究百部止咳的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)获取并筛选百部主要活性成分及其对应的作用靶点,利用Uniprot蛋白质数据库将作用靶点标准化,利用Cytoscape构建百部“成分–靶点”网络;利用GeneCards获取并筛选疾病“咳嗽”的作用靶点,利用VENNY获取交集靶点,将结果提交至String平台,获取蛋白质–蛋白质相互作用(PPI)网络;使用metascape进行基因本体(GO)富集分析与京都基因
【机 构】
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黑龙江省中医药科学院,黑龙江 哈尔滨 150036
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目的 利用网络药理学探讨百部发挥止咳作用的活性成分、作用靶点及相关通路,探究百部止咳的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)获取并筛选百部主要活性成分及其对应的作用靶点,利用Uniprot蛋白质数据库将作用靶点标准化,利用Cytoscape构建百部“成分–靶点”网络;利用GeneCards获取并筛选疾病“咳嗽”的作用靶点,利用VENNY获取交集靶点,将结果提交至String平台,获取蛋白质–蛋白质相互作用(PPI)网络;使用metascape进行基因本体(GO)富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并通过微生信平台将结果进行可视化,根据与咳嗽相关程度对通路进行筛选,利用Cytoscape构建百部“成分–靶点–通路”网络.利用RT-PCR法检测前列腺素内过氧化物合成酶2(PTGS2)、胱天蛋白酶3(CASP3)、丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)mRNA水平上的表达变化.结果 获取及筛选得到百部活性成分28个,作用靶点96个,咳嗽靶点1170个,交集靶点39个;GO功能富集分析显示其与对雌二醇、类固醇激素、脂多糖、药物的反应及血管形态发生及血管发育等相关,KEGG通路富集分析显示其与T细胞受体信号通路、Nod样受体信号通路、MAPK信号通路、VEGF信号通路、NF-κB信号通路等相关.RT-PCR结果表明百部对PTGS2、CASP3、MAPK14表达有明显的抑制作用.结论 百部可能通过抑制PTGS2、CASP3、MAPK14因子的表达发挥止咳作用,为探究百部止咳的作用机制提供了理论参考.
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